Se cuestiona la compatibilidad legal del acuerdo de asociación propuesto entre la UE y el Mercosur, así como del acuerdo comercial interino, con los tratados de la UE. El núcleo del debate es la división del acuerdo original en dos instrumentos separados por decisión de la Comisión. Se duda si este cambio respeta los principios de atribución de competencias y cooperación leal entre instituciones. Además, existen preocupaciones sobre el cumplimiento de los estándares ambientales, sanitarios y de protección al consumidor de la UE. El Parlamento solicita un dictamen del Tribunal de Justicia para aclarar la distribución de competencias y la legitimidad democrática.